Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL38Q2WGJ6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms