Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PPP1R3AQ16821 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms