Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NDUFA9Q16795 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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NDUFA9Q16795 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NDUFA9Q16795 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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