Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACKR1Q16570 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms