Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPE65Q16518 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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