Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA6Q15825 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHRNA6Q15825 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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