Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SIX1Q15475 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SIX1Q15475 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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