Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SHBQ15464 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SHBQ15464 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHBQ15464 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHBQ15464 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SHBQ15464 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHBQ15464 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHBQ15464 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHBQ15464 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHBQ15464 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SHBQ15464 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms