Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LAPTM4AQ15012 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms