Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NCAPHQ15003 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NCAPHQ15003 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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