Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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RFTN1Q14699 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RFTN1Q14699 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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