Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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ZNF235Q14590 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms