Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SEMA3AQ14563 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SEMA3AQ14563 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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