Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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GBX1Q14549 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GBX1Q14549 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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