Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK13Q14004 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK13Q14004 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
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