Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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PKP1Q13835 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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PKP1Q13835 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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PKP1Q13835 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PKP1Q13835 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PKP1Q13835 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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PKP1Q13835 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKP1Q13835 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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