Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NCOA4Q13772 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NCOA4Q13772 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms