Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACNA1SQ13698 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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