Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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CUL4AQ13619 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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CUL4AQ13619 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CUL4AQ13619 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CUL4AQ13619 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CUL4AQ13619 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CUL4AQ13619 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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CUL4AQ13619 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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CUL4AQ13619 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CUL4AQ13619 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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