Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PMS2P3Q13401 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PMS2P3Q13401 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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PMS2P3Q13401 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PMS2P3Q13401 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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