Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF3Q13114 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms