Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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IFT88Q13099 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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IFT88Q13099 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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IFT88Q13099 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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IFT88Q13099 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFT88Q13099 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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