Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDC16Q13042 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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