Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIK3Q13003 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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