Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FOXD4Q12950 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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FOXD4Q12950 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FOXD4Q12950 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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