Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPRJQ12913 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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PTPRJQ12913 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTPRJQ12913 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PTPRJQ12913 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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