Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EP300Q09472 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EP300Q09472 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EP300Q09472 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EP300Q09472 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EP300Q09472 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EP300Q09472 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EP300Q09472 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EP300Q09472 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms