Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4DQ08499 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms