Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TGM3Q08188 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms