Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LRP1Q07954 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms