Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TFF3Q07654 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms