Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SLC18A2Q05940 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms