Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PTPN12Q05209 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPN12Q05209 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms