Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
ATP7AQ04656 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP7AQ04656 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms