Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARDQ03181 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PPARDQ03181 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms