Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNC1Q01954 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms