Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCN7AQ01118 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCN7AQ01118 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms