Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms