Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELF3P78545 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELF3P78545 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms