Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SKP1P63208 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SKP1P63208 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms