Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RPS29P62273 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS29P62273 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RPS29P62273 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RPS29P62273 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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