Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVK11-1P61568 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVK11-1P61568 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms