Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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TMEM258P61165 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
TMEM258P61165 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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