Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVFRD-1P60508 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms