Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EEFSECP57772 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms