Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NUP107P57740 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NUP107P57740 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NUP107P57740 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms