Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BACE1P56817 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BACE1P56817 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms