Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNU13P55769 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNU13P55769 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms