Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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PGGT1BP53609 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PGGT1BP53609 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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