Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARFIP1P53367 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms